Hört sich für mich danach an als ob der Sync zu Deinem Online Speicher nicht vollständig ist. Du solltest warten bis das komplett abgeschlossen ist.
Alternativ kannst Du auch mal z.B. mit cyberduck den Tresor online öffnen. Da auch die Android app den Tresor direkt online öffnet sollte zwischen beiden Anwendungen kein Unterschied bezüglich des Tresor Inhalts sein.
Bitte auch das syncback Protokoll prüfen. Nicht dass hier Fehler aufgeführt werden die den Sync einzelner Dateien verhindern.