Ein leerer Tresor vor allem zwei Ursachen:
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Es wird WebDAV verwendet und mindestens eine Datei ist beschädigt, siehe https://github.com/cryptomator/cryptomator/issues/1273. Dann musst du Dokany (oder WinFSP) verwenden.
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Das Wurzelverzeichnis wurde nicht/nicht korrekt synchronisiert, siehe Empty Vault, but still allocates Space